El estado actual de los recursos marinos en general está cambiando la visión tradicional del mar como una fuente inagotable. Como consecuencia hoy en día se impulsan iniciativas o estrategias que busquen la conservación de los hábitats marinos y la recuperación de las especies sobreexplotadas.

La situación en las aguas marinas costarricenses no escapa a esta realidad mundial. De hecho, recursos pesqueros importantes en el Pacífico Oriental han disminuído notablemente. Tal es el caso de poblaciones de peces tradicionales como las corvinas (Scianidae) y pargos (Lutjanidae) en las pesquerías artesanales costeras. Además del dorado (Coryphaena hippurus), y picudos (Istiophoridae) en las pesquerías de avanzada y media escala en aguas pelágicas. Con el descenso en las poblaciones de interés comercial ha aumentado la captura de otras especies complementarias como los tiburones. Al mismo tiempo especies no comerciales como rayas, anguilas, tortugas, cetáceos y aves marinas cada vez son más capturadas por los artes pesqueros.

Ante este escenario se promueven iniciativas de conservación y acciones de manejo para las pesquerías mundiales. Sobresalen, la disminución del esfuerzo pesquero, la creación de Áreas Marinas Protegidas, límites o cuotas de descargas, entre otras cosas. Sin embargo en la actualidad, la carencia de información básica no permite un manejo adecuado para los recursos marinos. Es por esto que PRETOMA ha venido trabajando de la mano con el sector pesquero costarricense realizando investigaciones que suministren información científica básica sobre Pesquerías artesanales (Línea de fondo y trasmallos), semiindustriales (camaroneros) y de avanzada (pesca de palangre). Al mismo tiempo PRETOMA está recolectando información científica relacionada con patrones migratorios, abundancia y estacionalidad de especies marinas. Dentro de los programas de Marcaje y Red de Avistamientos se recolectan datos sobre la presencia y comportamiento de especies emblemáticas como el tiburón martillo común (Sphyrna lewini) y el tiburón ballena (Rhincodon typus) en aguas costarricenses.

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